Masashi Kishimoto nasce a Okayama nel 1974. Fin dall'infanzia il suo interesse per il disegno era elevato e ben presto capì che più che un passatempo quello del disegno potesse diventare un lavoro. Con i suoi primi lavori egli si ispirò a molti anime visti in televisione (Doraemon, Gundam).
La sua passione per i Manga creebbe durante la frequenza alle lementari e grazie alla "Leggenda" di Dragon Ball di cui produceva continuamente delle caricature. Il suo prima manga era intitolato Hitari-kun, una storia incentrata su un Ragazzo ninja dell’ombra. Per un certo periodo Kishimoto abbandonò la sua vocazione per dedicarsi nello studio, ma un giorno, per pura fortuna cominciò a conoscere il mito di Katsuhiro Otoma (Akira). Masashi cercò di imitare lo stile di Otoma, ma ben presto capì che imitando lo stile degli altri non avrebbe mai realizzato qualcosa di originale.
Cominciò a creare dei piccoli manga di 31 pagine. Fece leggere le sue prime produzioni al fratello, lo stesso fece con il padre, ma i loro pareri erano del tutto negativi. Kishimoto non si abbattè e cercò di coltivare la sua passione e a migliorarsi. Non appena si presentava l’occasione dava sfoggio alla sua fantasia disegnando, finché non entrò in una scuola artistica. Qui espose una sua opera, Karakuri che lo porterà a vincere un importante premio, ovvero l’Hot Steps. Comincia così la sua carriera segnata, inizialmente, da molte difficoltà e anche alcuni flop. Nonostante tutto, la sua passione e la sua voglia di disegnare lo aiutò a superare le difficoltà e iniziò a concretizzare quello che poi diventerà uno dei manga più seguiti in Giappone grazie al suo immediato successo: Naruto.La particolarità di Naruto sta nel fatto che Kishimoto rielabora in chiave moderna quelle tradizioni dei samurai e dei ninja che caratterizzarono il Giappone del passato. Ora Masashi è uno dei più grandi mangaka in circolazione, grazie appunto a Naruto.
Suo fratello gemello Seishi Kishimoto anch'egli un mangaka ed è l'autore di 666 Satan.Spesso è stato fatto notare che i loro disegni sono molto simili, e spesso sono stati accusati entrambi di plagio. Tuttavia, Seishi ha fatto notare in uno dei volumi del suo manga che le somiglianze non sono intenzionali e sono probabilmente dovute al fatto che entrambi gli autori sono stati influenzati dalle stesse cose.
